Formaldehit fiksasyonu, bir çok antijen ve epitopun immünoreaktivitesini bozar veya tamamen yok eder. Formaldehit fiksasyonunun olumsuz etkisi, bazı belirteçler için enzimatik sindirim ile başarılı bir şekilde tersine çevrilebilirken diğerleri için mümkün değildir. Proteaz, formalinle sabitlenmiş, parafine gömülmüş immünohistokimyasal prosedürlerde epitopların maskesinin kaldırılması için yaygın olarak kullanılan bir sindirim enzimidir. Proteaz, formaldehitle sabitlenmiş dokulardaki bazı antijenlerin immünoreaktivitesini geliştirmede çok etkilidir.